意思是特定时间特定生境中微生物群所包含的基因序列（含同源序列）的总和。
微生物群（microbiota）是特定时间特定生境所有微生物有机体的总称，其组成包括非细胞结构的病毒（包括噬菌体）、原核生物中的真细菌和古细菌，以及真核细胞微生物。
微生物组学就是对某一特定环境中全部微生物的总和进行系统性研究并研究其之间的相互作用。某一特定环境（比如说人类体内）中全部微生物，包括其DNA序列等遗传信息，的总和，便是微生物组。
微生物组学是指研究动植物体上共生或病理的微生物生态群体。微生物组包括细菌、古菌、原生动物、真菌和病毒等。研究表明其在宿主的免疫、代谢和激素等方面非常重要。
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